Trascrittomicità cellulare singola rivela eterogeneità e microambiente immunitario nella metastasi linfatica del carcinoma squamocellulare di testa e collo.

Il carcinoma squamocellulare della testa e del collo (HNSCC) è una preoccupazione sanitaria importante con una considerevole morbosità e mortalità a livello mondiale. Gli studi precedenti hanno applicato la sequenziamento a cellule singole per caratterizzare l'ambiente tumorale nel HNSCC, fornendo informazioni sull'immunità cellulare, le interazioni stromali e gli stati cellulari maligni. Tuttavia, rimane un gap nell'analizzare la metastasi linfonodale (LM) e i tessuti linfonodali normali (LN) utilizzando l'analisi del sequenziamento RNA a cellule singole (scRNA-seq). Abbiamo eseguito un'analisi scRNA-seq comparativa su sette tessuti metastatici linfonodali di pazienti con HNSCC e cinque tessuti non metastatici. Abbiamo identificato diversi tipi cellulari con livelli di espressione significativamente alterati NORMATIVA E METODI La nostra analisi è stata condotta utilizzando un approccio di sequenziamento RNA a cellule singole (scRNA-seq) e un algoritmo di analisi per identificare le cellule con livelli di espressione alterati. I dati scRNA-seq sono stati ottenuti utilizzando la tecnologia di sequenziamento a singolo passo (SBS) e sono stati analizzati utilizzando l'algoritmo di analisi "Seurat". I dati sono stati normalizzati e ridotti utilizzando l'algoritmo "Seurat" e sono stati eseguiti gli esperimenti di analisi utilizzando l'algoritmo "Limma". RISULTATI La nostra analisi ha rivelato che i tessuti metastatici linfonodali di pazienti con HNSCC presentano una composizione cellulare diversa rispetto ai tessuti non metastatici. Siamo stati in grado di identificare diverse cellule con livelli di espressione significativamente alterati, tra cui cellule immunitarie, cellule stromali e cellule maligne. I nostri risultati suggeriscono che la metastasi linfonodale nel HNSCC è associata a una modifica della composizione cellulare e della espressione genica. DISCUSSIONE I nostri risultati confermano che la metastasi linfonodale nel HNSCC è un processo complesso che coinvolge la modifica della composizione cellulare e della espressione genica. La nostra analisi ha rivelato che i tessuti metastatici linfonodali di pazienti con HNSCC presentano una diversa composizione cellulare rispetto ai tessuti non metastatici. I nostri risultati suggeriscono che la metastasi linfonodale nel HNSCC è associata a una modifica della composizione cellulare e della espressione genica. CONCLUSIONI La nostra analisi ha rivelato che la metastasi linfonodale nel HNSCC è associata a una modifica della composizione cellulare e della espressione genica. I nostri risultati suggeriscono che la metastasi linfonodale nel HNSCC è un processo complesso che coinvolge la modifica della composizione cellulare e della espressione genica. I nostri risultati potrebbero avere implicazioni per la comprensione e il trattamento del HNSCC.