Biodiversità e biogeografia del microbioma cancro multi-regno.

Gli organismi microbici rappresentano un componente importante dell'ambiente tumorale, ma i rapporti discordanti hanno lasciato incerto l'estensione della prevalenza microbica nei diversi tipi di cancro, rendendo necessarie metodi più robusti per caratterizzare le microbiomi associate ai tumori. Abbiamo costruito e valutato un pipeline di sottrazione di ospite e classificazione per identificare la microbiota nei dati di sequenziamento del genoma integrale e l'abbiamo applicato a 16.369 genomi tumorali di alta profondità provenienti dal Progetto UK 100.000 Genomi. Dopo la decontaminazione, i segni microbici erano indistinguibili dallo sfondo in quasi tutti i tipi di cancro. Tuttavia, nei tumori orodigestivi, abbiamo rilevato comunità polimicrobiche multi-regno, compresi batteri, funghi Nota: - "host-subtraction" è stato tradotto con "sottrazione di ospite" per mantenere la stessa struttura e il significato originale. - "whole-genome sequencing data" è stato tradotto con "dati di sequenziamento del genoma integrale". - "UK 100,000 Genomes Project" è stato tradotto con "Progetto UK 100.000 Genomi". - "decontamination" è stato tradotto con "decontaminazione". - "orodigestive tumors" è stato tradotto con "tumori orodigestivi".